總統馬英九從善如流，自刪一千萬國務機要費，行政院長陳冲也刪減聯繫費後，五都首長的特別費成為關注焦點。

台北市長郝龍斌11月6日率先表示，明年度北市府所有首長特別費以撙節四分之一、約一千四百多萬元為目標，另外也要求各局處停辦不必要活動，目標為市庫省下年度總預算百分之一的支出（約十八億元）。

之後，新北市長朱立倫也隨即跟進宣布，配合中央刪除四分之一的特別費。

目前五都首長薪資結構為，市長每月本俸新台幣19萬5百元，每月特別費則為20萬元。除了郝、朱外，高雄市長陳菊也表態刪減28％，刪減後，北市、新北市特別費剩15萬，高雄市剩14萬4千元，至於台中市長胡志強、台南市長賴清德則說，尊重議會。

特別費（特支費）是為提供公務機關首長基於公務、公關需要，所編列的業務費，可用於婚喪喜慶禮金、輓聯等支出，犒賞、慰問內部員工，以及招待單位外部支出。採實報實銷，未用完須於年底繳庫返還。

因為特別費，曾衍生過不少爭端，當時馬英九還被綠營緊咬，將台北市長任內的特支費做為私用，而後，火倒燒到時任總統陳水扁身上，牽扯出更多的弊端，被視為政黨輪替關鍵因素之一。