扁批評，馬政府這種抄家滅族、趕盡殺絕的政治報復，好像又回到戒嚴時期警總動輒沒收「叛亂犯」的財產。只是「懲治叛亂條例」早就廢除了，警總也不存在了。

扁也批評，有不同政治立場的媒體主持人、名嘴，為特定政黨服務效勞，甚至淪為政黨惡鬥的打手，製造不實輿論，形成媒體審判，「部分法官邊看電視、報紙邊辦案，不是自甘被指揮，就是甘受利用；看到媒體輿論的批判、恐嚇；法官心生畏懼，在強力的輿論審判壓力下，很難做到獨立審判，不受任何干涉」。

扁說，他很遺憾，偵查中的案件，違背偵查不公開的報導評論早已不是新聞，胡亂指揮檢察官如何偵辦、押人，更毫不遮掩，公然為之。對審判中的案子，政論性節目「私設刑堂」，有罪無罪，刑度輕重，羈押與否，全都干預，「這是台灣司法的最大悲哀，對台灣司法要成為社會公義最後一道防線，無異是最大的缺口」。

扁還提出，就是因為輿論審判凌駕司法審判，為了顧及統媒及深藍的「觀感」與「期待」，明知海外匯款已回來9成，全部都已超過高院判決有罪的2倍以上，易言之有一半以上的錢都是合法的。其中一成的差額是3年前的鑑價，已經因為景氣變化貶值，或在處分金融商品時的虧損利差，已無資金可供逃亡之用，「但高院就是付出贖金也不放掉人質」。